Les 5 distributions Ultimate Scientific Linux

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Il est temps pour un quiz pop: quelles sont les distributions Linux scientifiques?

La réponse est assez évidente: alors que la plupart des distributions Linux sont à usage général, certaines spécialisées sont livrées avec certains types de logiciels. Par exemple, il existe distributions du centre des médias 5 grandes distributions Linux Media Center pour transformer votre téléviseur Lire la suite , ceux qui transforment votre ordinateur en studio de production multimédia, et même quelques-uns distributions religieuses Les discothèques religieuses les plus intéressantes pour LinuxLa créativité et la liberté de la plate-forme Linux permettent à tout développeur d'explorer ses propres convictions, tout en fournir aux autres un système d'exploitation préchargé avec les meilleurs outils d'observance religieuse que Linux doit offre. Lire la suite . Sachant cela, cela ne devrait pas vous surprendre que des distributions scientifiques Linux existent. Après tout, l'histoire de Linux Penguin Origins: L'histoire de Linux [Geek History]

Il n'y a pratiquement aucun endroit où aller sans être en contact avec Linux - il alimente tout, des ordinateurs ordinaires aux serveurs les plus puissants en passant par nos appareils mobiles portables. La plupart des gens qui ne sont pas des techniciens ... Lire la suite a commencé dans les laboratoires de recherche, et aujourd'hui Linux alimente les serveurs Linux est partout: 10 choses que vous ne saviez pas étaient alimentées par PenguinSi vous pensez que le monde repose sur Windows, détrompez-vous. Linux joue un rôle crucial dans le maintien de notre monde. Lire la suite et les postes de travail des plus grands organismes de recherche au monde.

En termes simples, les distributions scientifiques proposent des logiciels préinstallés à des fins de recherche diverses. Bien sûr, vous pouvez transformer votre Ubuntu habituel en une distribution scientifique en installant ces mêmes applications, mais le but de ces distributions est d'éviter de rechercher des applications individuelles. Au lieu de cela, ils fournissent un moyen rapide de déployer Linux dans des installations de recherche, des établissements d'enseignement et sur les ordinateurs personnels des étudiants et des utilisateurs curieux des sciences. Si vous faites partie de ces derniers, voici cinq grandes distributions scientifiques à considérer.

Cette distribution de couleur verte est destinée aux scientifiques qui travaillent en bioinformatique - une interdisciplinaire domaine qui combine la biologie moléculaire et la génétique avec des statistiques et des méthodes d'analyse par ordinateur science. Développé au Environmental Omics Synthesis Center au Royaume-Uni, Bio-Linux est soutenu et financé par le Center for Ecology & Hydrology (CEH) et le Natural Environment Research Council (NERC).

Il s'agit d'une distribution basée sur Ubuntu disponible uniquement pour les systèmes 64 bits, et elle propose deux environnements de bureau: Unity par défaut et MATE comme alternative légère Un examen de MATE: est-ce une véritable réplique GNOME 2 pour Linux?Le monde des environnements de bureau Linux a radicalement changé depuis lors. Gnome 3 est né, Gnome 2 a été essentiellement jeté sur le côté, Gnome 3 a été bifurqué pour créer de la cannelle, etc. Cependant, Gnome ... Lire la suite . La dernière version (8.0.5) garantit un support à long terme grâce à son noyau Ubuntu 14.04. Bio-Linux 8 contient littéralement des centaines d'outils de bioinformatique, à la fois en ligne de commande et graphiques. Pour vous aider à démarrer, Bio-Linux propose un guide PDF.

Points forts du logiciel: Artemis, une visionneuse de séquences d'ADN et une application d'annotation; Galaxy, une plateforme de recherche biomédicale basée sur un navigateur; Fasta, pour la recherche de bases de données d'ADN et de protéines; Mesquite, pour la biologie évolutive; njplot, pour dessiner des arbres phylogénétiques, et Rasmol, pour visualiser les macromolécules. Si vous souhaitez installer des packages à partir de Bio-Linux sur votre système basé sur Ubuntu, vous pouvez simplement ajouter leurs référentiels.

Bio-Linux est disponible gratuitement comme une image Live et comme un fichier OVA au cas où vous voudriez l'exécuter dans VirtualBox.

Alternative: BioSLAX, une distribution scientifique basée sur Slackware axée sur la bioinformatique et développée à l'Université nationale de Singapour.

Comme Bio-Linux, Poseidon Linux a également un schéma de couleurs: des tons bleus doux qui correspondent à son nom marin. La marque a été inspirée par les océanologues qui travaillent sur le projet, mais Poseidon Linux n'est pas destiné à une seule branche de la science. Au lieu de cela, il offre une large gamme d'outils, de la visualisation 2D et 3D, de la génétique et des applications de programmation à la prise en charge des statistiques, de la modélisation numérique et de la cartographie.

Poseidon Linux est le résultat d'une coopération transatlantique entre l'Université fédérale de Rio Grande au Brésil et l'Institut MARUM en Allemagne. La version stable actuelle (4.0) est à la traîne, car elle est basée sur Ubuntu 10.04. Cependant, Poseidon 5.0 est en développement, et il promet un support à long terme (en s'appuyant sur Ubuntu 12.04) et Unity comme environnement de bureau par défaut - une mise à niveau bienvenue de l'ancien GNOME 2.30 fourni avec Poseidon 4.0.

Points forts du logiciel: Lab Plot, pour le graphisme interactif et l'analyse des données; QCAD, pour le dessin 2D; Blender, pour la modélisation 3D, et QGIS, un système d'information géographique complet.

Vous pouvez télécharger Poseidon Linux gratuitement dans les éditions 32 et 64 bits.

Alternative: Si vous n'avez besoin que d'outils de géographie et de cartographie, essayez OSGeo, un produit basé à Lubuntu de l'Open Source Geospatial Foundation.

3. CAElinux [n'est plus disponible]

L'indice est dans le nom: CAE signifie Computer-Aided Engineering, et cette distribution scientifique est parfaite pour tous ceux qui travaillent avec la CAO, la modélisation, le prototypage, l'impression 3D et les simulations physiques. Développé en Suisse, CAElinux est basé sur Xubuntu 12.04 et nécessite un système 64 bits. Il n'offre aucune version de bureau en dehors de Xfce, mais sa sélection de logiciels est impressionnante.

Points forts du logiciel: Salomé, pour CAO 3D et maillage; GMSH, pour la modélisation géométrique; Scilab, pour la programmation mathématique; Paraview, pour la visualisation 3D; ImageJ, pour le traitement et l'analyse d'images, et Elmer, pour les modèles physiques complexes.

CAElinux est disponible gratuitement en tant qu'image DVD Live, ou vous pouvez commander une copie physique à un prix abordable.

Alternative: Si vous n'avez pas besoin de tous les logiciels d'ingénierie avancés et que vous voulez juste des outils de modélisation et d'animation 3D, essayez ArtistX, qui nous avons couvert en détail ArtistX: la distribution Linux adaptée à tout artiste, graphique ou musical Lire la suite .

Après toutes ces distributions basées sur * buntu, Scientific Linux est un véritable disjoncteur: c'est une reconstruction de Red Hat Enterprise Linux. La dernière version (7.1, nom de code Nitrogen) est sortie récemment, en trois versions: KDE, GNOME et IceWM 8 excellents gestionnaires de bureau alternatifs pour Linux Lire la suite —Pour les systèmes 64 bits uniquement. Cependant, sa base n'est pas la seule chose qui distingue Scientific Linux. Contrairement à d'autres distributions qui regorgent de logiciels scientifiques, Scientific Linux ne propose qu'un ensemble de base d'applications. Quelle distro sournoise et trompeuse!

Eh bien pas vraiment. Scientific Linux est en fait développé par des scientifiques du Laboratoire national d'accélérateurs de Fermi et de l'Organisation européenne pour la recherche nucléaire (CERN). Bien qu'il n'offre pas de nombreuses applications scientifiques par défaut, il existe des dizaines facilement disponibles dans les référentiels. Avec des codecs et une prise en charge sans fil prêts à l'emploi, Scientific Linux est un excellent choix pour un environnement scientifique dans lequel tout devrait fonctionner sans trop bricoler. Les utilisateurs peuvent installer uniquement les logiciels dont ils ont besoin, afin que leur système ne soit pas encombré d'applications qu'ils n'ouvriront jamais.

Points forts du logiciel: PostgreSQL et MySQL, pour le développement de bases de données et d'applications; Éditeur de texte GNU Emacs; Langage de programmation R; Frysk, pour l'analyse et la surveillance du système, et gnuplot, pour tracer des expressions mathématiques. (Notez que certaines de ces applications ne seront pas installées par défaut, mais vous pouvez les récupérer dans les référentiels.)

Scientific Linux peut être téléchargé en tant que Image DVD en direct.

Alternative: Les développeurs de Scientific Linux encouragent la création de «spins» ou de builds basés sur leur projet. Une telle distribution est Fermi Linux; une bonne option axée sur la sécurité pour ceux qui souhaitent exécuter Scientific Linux sur un système 32 bits.

Ce spin de Fedora représente le juste milieu entre une distribution Linux hautement spécialisée et ordinaire. En tant que tel, il est idéal pour les chercheurs et les étudiants de tous horizons scientifiques, même s'il penche légèrement en faveur de la recherche numérique. L'environnement de bureau par défaut est KDE et Fedora Scientific est disponible pour les architectures 32 bits et 64 bits. Il est développé par Amit Saha avec le soutien de Fedora Science and Technology SIG. Beau documentation en ligne vous présentera Fedora Scientific et vous guidera dans sa sélection de logiciels.

Points forts du logiciel: Maxima, une suite d'algèbre complète; LaTeX, pour créer des documents et des présentations; Mayavi, pour la visualisation de données 3D, et contrôle de version Pas seulement pour les codeurs: les meilleurs systèmes de contrôle de version pour les écrivainsLa mention du contrôle de version ou du contrôle de révision fait que cela ressemble à quelque chose pour les geeks. Vous serez surpris de savoir que les systèmes de contrôle de version ont leur place non seulement dans la rédaction académique mais aussi dans ... Lire la suite trifecta: git, Mercurial et Subversion.

Vous pouvez télécharger Fedora Scientific Live DVD soit par téléchargement direct, soit sous forme de torrent.

Alternative: Si vous recherchez une distribution scientifique conviviale axée sur les mathématiques, Mathbuntu est un excellent remplacement pour Fedora Scientific. Il est disponible sous forme de distribution autonome ou sous forme d'ensemble de packages pour votre installation actuelle d'Ubuntu.

Quel que soit le domaine scientifique qui vous intéresse, vous devriez pouvoir choisir une distribution appropriée dans cette liste. Maintenant, revenons à ce quiz pop ...quelle est votre distribution Linux scientifique préférée? Pouvez-vous nommer d'autres distributions similaires qui méritent une place sur cette liste? Faites vos devoirs et partagez vos recommandations dans les commentaires.

Crédits image:L'image sélectionnée, Mur de surveillance basé sur Nagios dans le CNO via Flickr par Docklandsboy, Capture d'écran de Poséidon, Capture d'écran de CAElinux, Linux scientifique via Wikimedia Commons, Capture d'écran de Fedora Scientific.